Il est dirigée par un Inspecteur Général des Services (IGS) nommé par décret pris en Conseil des Ministres sur proposition du Ministre. Il veille à l’application de la politique du département, assure le suivi-conseil et le contrôle du fonctionnement des services, projets et programmes. A ce titre, elle est chargée :

• de l’appui-conseil pour l’élaboration et la mise en œuvre des programmes d’activités des services, projets et programmes;
• du contrôle de l’application des textes législatifs, réglementaires et des instructions administratives régissant le fonctionnement administratif, financier et comptable des services, projets et programmes;
• des investigations relatives à la gestion administrative, technique et financière des services, projets et programmes;
• de l’étude des réclamations des administrés et des usagers des services, projets et programmes;
• de la lutte contre la corruption au sein du ministère.